PN19.29.01.03 Cell Biology

Proiect nucleu PN19.29 (contract 1N/2019)

SISPATH

Abordari sistemice in identificarea si/sau validarea de tinte moleculare pentru strategii terapeutice in patologii cu impact major pentru sanatate

Institutia Coordonatoare: Institutul National de Cercetare-Dezvoltare in Domeniul Patologiei si Stiintelor Biomedicale “Victor Babes” (IVB), Director Proiect: Prof. Mihail Eugen Hinescu

Titlul proiectului component PN19.29.01.03: Inovare tehnologica privind detectia amprentelor genetice – aplicatii in monitorizarea celulelor tumorale reziduale si a regenerarii hematopoietice post-transplant

Buget proiect PN19.29.01.03: 4420000 RON

Responsabil proiect PN19.29.01.03:

Dr. Valeriu Cismasiu (2019-2020)

Dr. Laura Cristina Ceafalan (2021-2022)

Echipa IVB implicata in PN19.29.01.03: Sevinci Pop, Gisela Gaina, Cristina Niculite, Stefania Rogozea/Alexandra Popa (Gruianu), Ioana Lambrescu, Victor Ionescu, Aurora Arghir, Sorina Papuc, Alina Erbescu

Abstract

Testele moleculare sunt esentiale pentru un diagnostic complet si un tratament țintit al pacientului. Răspunsul organismului la tratament este greu de anticipat; prin urmare, pacienții trebuie monitorizați prin teste moleculare pentru a determina dacă tratamentul este eficient sau trebuie modificat. Aplicarea pe scara larga a metodelor moderne de secvențiere a condus catre progrese majore în diagnosticul molecular. Astfel, au fost descoperite noi mutații asociate cu diferite tipuri de patologii oncologice, permițând un diagnostic mai bun și un prognostic mai eficient. Domeniul este în continuă evoluție, seturile de mutații stabilite sunt reclasificate anual în ceea ce privește utilizarea lor în diagnostic și prognostic. Proiectul are ca scop general realizarea unor truse moleculare adecvate metodelor moderne de PCR, pentru identificarea amprentelor genetice celulare. Studiul este conceput astfel încât (1) rezultatele obtinute să fie utile in medicina de laborator, (2) genele testate să fie caracteristice unui spectru divers de tumori, (3) iar tehnica optimizată să fie aplicabilă pentru cuantificarea mai multor tipuri de mutații genetice.

Obiective

Obiectivul general al proiectului este de a produce și optimiza truse pentru evaluarea amprentelor genetice (mutații) prin tehnici moderne PCR, și anume TaqMan, ddPCR și rhPCR. Obiectivele specifice: stabilirea metodelor de analiză a anomaliilor genetice pentru care nu există astfel de proceduri în laboratorul clinic; metode noi cu performante sporite fata de cele folosite in prezent in clinica.

Brevete in evaluare

RO134998: Cismasiu VB et al. 2019; Set de doi primeri și o sondă pentru detecția și dozarea expresiei genei NPM1 mutantă 

 

RO135856: Cismasiu VB et al. 2020; Amprentarea genetica umana prin detectia si dozarea unor mutatii de tipul insertiilor si deletiilor

Publicatii

Budisteanu, M., Papuc, S. M., Erbescu, A., Iliescu, C., Dobre, M., Barca, D., Tarta-Arsene, O., Motoescu, C., Dica, A., Sandu, C., Anghelescu, C., Craiu, D., & Arghir, A. (2022). Clinical and genomic findings in brain heterotopia: Report of a pediatric patient cohort from Romania. Experimental and therapeutic medicine, 23(1), 101. https://doi.org/10.3892/etm.2021.11024

 

Papuc, S. M., Erbescu, A., Cisleanu, D., Ozunu, D., Enache, C., Dumitru, I., Lupoaia Andrus, E., Gaman, M., Popov, V. M., Dobre, M., Stanca, O., Angelescu, S., Berbec, N., Colita, A., Vladareanu, A. M., Bumbea, H., & Arghir, A. (2021). Delineation of Molecular Lesions in Acute Myeloid Leukemia Patients at Diagnosis: Integrated Next Generation Sequencing and Cytogenomic Studies. Genes, 12(6), 846. https://doi.org/10.3390/genes12060846

 

Lambrescu, I., Popa, A., Manole, E., Ceafalan, L. C., & Gaina, G. (2022). Application of Droplet Digital PCR Technology in Muscular Dystrophies Research. International journal of molecular sciences, 23(9), 4802. https://doi.org/10.3390/ijms23094802

 

Gaina, G., & Popa Gruianu, A. (2021). Muscular dystrophy: Experimental animal models and therapeutic approaches (Review). Experimental and therapeutic medicine, 21(6), 610. https://doi.org/10.3892/etm.2021.10042

 

Gaina, G., Vossen, R. H. A. M., Manole, E., Plesca, D. A., & Ionica, E. (2021). Combining Protein Expression and Molecular Data Improves Mutation Characterization of Dystrophinopathies. Frontiers in neurology, 12, 718396. https://doi.org/10.3389/fneur.2021.718396

 

Lambrescu, I. M., Lambrescu, I. M., Martin, S., Martin, S., Cima, L. N., Cima, L. N., Fica, S., & Fica, S. (2022). Assessment of peripheral blood cells parameters as a valuable tool in patients with neuroendocrine neoplasms. Neuro endocrinology letters, 43(1), 45–54.

 

Fertig, T. E., Chitoiu, L., Marta, D. S., Ionescu, V. S., Cismasiu, V. B., Radu, E., Angheluta, G., Dobre, M., Serbanescu, A., Hinescu, M. E., & Gherghiceanu, M. (2022). Vaccine mRNA Can Be Detected in Blood at 15 Days Post-Vaccination. Biomedicines, 10(7), 1538. https://doi.org/10.3390/biomedicines10071538

 

Ionescu, V. S., Popa, A., Alexandru, A., Manole, E., Neagu, M., & Pop, S. (2021). Dietary Phytoestrogens and Their Metabolites as Epigenetic Modulators with Impact on Human Health. Antioxidants (Basel, Switzerland), 10(12), 1893. https://doi.org/10.3390/antiox10121893

 

Comunicari

1) Improved Chimerism Detection through RNA-based rhAmp Genotyping. Ionescu V et al., Modern Biotechnical Advances for Human Health (BAHH2) – Bucharest, 28-31.05.2019

 

2) Unlimited Gene Expression Meta-analysis through Microarray Data Mining. Ionescu V et al., the 12th National Pathology Symposium, Bucharest, 21-23.11.2019, Abstract Book page 86, ISSN 2601-0770;

 

3) Blending the precision of RNase h-dependent PCR with the accuracy of digital droplet PCR – the good, the bad and the “rain”. Lambrescu I et al., the 12th National Pathology Symposium, Bucharest, 21-23.11.2019, Abstract Book pag 92, ISSN 2601-0770;

 

4) Novel PCR based tools in molecular diagnostics. Cismasiu V., the 12th National Pathology Symposium, Bucharest, 21-23.11.2019, Abstract Book p36, ISSN 2601-0770;

 

5) Molecular characterization of acute myeloid leukemia by next generation sequencing and microarray technologies. Arghir A et al., European Conference of Cytogenetics, Salzburg, Austria, 6-9.07.2019, Molecular Cytogenetics, Volume 12, Supplement: 1, Meeting Abstract: 2. pag 12;

 

6) Sanger sequencing and fragment analysis for FLT3-ITD molecular characterization in acute myeloid leukemia patients at diagnostic. Erbescu A et al., Conference of Medical genetics, Timisoara, 18-20.09.2019, Romanian Journal of Rare Diseases, Supplement 2019, pag 47, ISSN 2068-5882

 

7) Molecular characterization of flt3-itd in acute myeloid leukemia patients at diagnostic, Erbescu A et al., Conference of the Romanian Association of Laboratory Medicine, Bucharest 2020

 

8) Molecular characterization of acute myeloid leukemia by next generation sequencing, Papuc SM et al., Conference of the Romanian Association of Laboratory Medicine, Bucharest 2020